La historia comienza con el episodio doble , donde la expedición liderada por la Dra. Elizabeth Weir utiliza un ZPM (Módulo de Punto Cero) para abrir un agujero de gusano hacia otra galaxia. Al llegar, descubren que Atlantis está sumergida bajo el océano y sus escudos están a punto de fallar. En su búsqueda de un nuevo hogar y tecnología, el equipo despierta accidentalmente a los Wraith (Espectros), una raza alienígena depredadora que se alimenta de la fuerza vital humana.
A lo largo de 20 episodios, el equipo debe sobrevivir sin contacto con la Tierra, enfrentándose a dilemas éticos, tormentas masivas en el planeta Lantea y la amenaza constante de un asedio inminente. Personajes Principales La historia comienza con el episodio doble ,
Un talentoso piloto con el gen de los Antiguos que se convierte en el líder militar de la expedición. En su búsqueda de un nuevo hogar y
El joven y entusiasta oficial que sirve como segundo de Sheppard durante esta temporada. Guía de Episodios Destacados El joven y entusiasta oficial que sirve como
El reparto de la primera temporada estableció una dinámica única entre ciencia y milicia:
Líder de los Athosianos y experta en la galaxia Pegasus, quien posee una conexión genética con los Wraith.